四川大学华西第二医院源于1896年成立的仁济女医院，开设妇产科和儿科。1987年国家卫生计生委批准华西妇产科和儿科从原华西医科大学附属医院迁出单独建院，成立华西医科大学附属第二医院，又名华西妇产儿童医院。2000年医院更名为“四川大学华西第二医院/华西妇产儿童医院”，是国家卫生计生委委属委管医院和全国首批“三级甲等”妇女儿童专科医院，是集医疗、教学、科研、预防保健和人才培养为一体的大学附属医院。1993年被国家卫生计生委、联合国儿童基金会和世界卫生组织授予“爱婴医院”称号，1998年被评为国家“三级甲等妇产儿童专科医院”，2003年被全国总工会授予“全国女职工先进集体”称号，2008年被全国总工会授予“抗震救灾，重建家园工人先锋号”旗帜，2009年被全国总工会授予“全国五一劳动奖状”，2012年获“全国三八红旗集体”称号。2014年医院首次荣获四川省城市医院管理优异奖；并在复旦大学医院管理研究所“中国较好医院排行榜”上连续三年位居全国妇女儿童医院一位。
      医院现有编制床位730张，占地17亩，建筑面积5.9万平方米，医疗业务用房面积4.1万平方米，拥有16个临床科室和5个医技科室。妇产科学和儿科学均为国家重点学科，儿科学为国家精品课程，妇科、产科、儿科新生儿专业为国家临床重点专科建设项目。医院拥有“出生缺陷与妇儿相关疾病教育部重点实验室（四川大学）”，“早期发育与损伤的基础与临床嵌合研究”教育部长江学者创新团队。妇科恶性肿瘤诊治、小儿血液病及小儿肿瘤诊治、早产儿支气管肺发育不良防治体系的建设与完善为卫生部临床学科重点项目。全国救治农村儿童白血病、先天性心脏病区域协作中心、中国出生缺陷监测中心、全国妇幼卫生监测办公室、国家药物临床试验机构、卫生部四级妇科内镜手术培训基地、专科医师培训基地、临床药师培训基地、儿科专业临床药师培训基地、全国产前诊断超声影像技术骨干培训基地、四川省妇产科质量控制中心、四川省儿科质量控制中心、四川省产前诊断中心、四川省人类精子库、四川省NICU专科护士培训基地和四川省产科母婴护理专科护士培训基地等均设在我院。2008年医院西部妇幼医学研究院正式挂牌。医院承办《中华妇幼临床医学杂志》（电子版）（中国科技核心期刊）、《国际输血与血液学杂志》两本杂志。
      医院现有职工1700余名，其中正高级师资122名（含退返45名），副高级师资117名（含退返10名），博士生导师27名，硕士生导师96名。千人计划特聘教授1人，国家杰出青年科学基金获得者1人，国家优异青年科学基金获得者1人，国家自然科学基金重点项目获得者1人，全国百篇优博论文获得者1人，教育部新世纪人才8名，四川省学术和技术带头人26人，四川省卫生厅学术和技术带头人67人，享受政府津贴和部、省级有突出贡献的中青年专家41人，教师队伍中留学回国人员占40%。我院在全国学术团体中，有中华预防医学会出生缺陷预防与控制专业委员会主任委员1人、中华医学会围产医学分会副主任委员1人、中华护理学会妇产科学专业委员会副主任委员1人、中国医师协会新生儿分会副会长、中华医学会儿科学分会青年委员会副主任委员1人、中华医学会围产医学分会青年委员会副主任委员1人、中华医学会妇科肿瘤分会青年委员会副主任委员1人、中华医学会医学工程分会青年委员会副主任委员1人。还拥有四川省和成都市医学会妇产科、儿科、生殖医学、遗传、药事管理专委会主任委员及副主任委员多名。妇产科学、儿科学、母婴医学和应激生物学为博士学位授权点，妇产科学和儿科学为博士后流动站。2011年，儿科周晨燕医师获得全国“我较喜爱的健康卫士”及“四川2011我较喜爱的健康卫士”称号，妇产科李尚为教授被中国教科文卫体工会授予“全国卫生系统职工职业道德建设标兵”称号。2015年，周晨燕医师获“全国三八红旗手”称号。
      医院承担成都市、四川省乃至西南地区的妇女儿童危重疾病病人的救治、转诊、会诊等大量临床工作。2014年医院门、急诊病人量创历史新高，达201.7万人次，住院病人5.2万人次，手术3.6万人次，分娩1.1万人次，平均住院日为5.6天(低于国内同类医院平均水平)。医院开设十余种业余门诊、特需门诊、名老专家和知名专家门诊及专科专病的特色门诊，许多妇产科、儿科疾病的诊治水平已达到国内先进水平。自2011年4月开始，我院妇产科实行周末及节假日专家专科门诊，实现“全年无休日门诊”，有效地缓解了病人看病难的问题。
      医院配置完备的医学检验检测仪器，检验科已通过ISO15189国际实验室认证及现场复评审，是西南地区头家通过该项评审的医院，检验结果在全球47个国家互认。同时，医院建设了完整的危重症监护体系，使危重病的抢救成功率达95%以上。产科中央监护网络系统、全程家庭胎儿监护系统等通过在医院或在家中对胎儿进行监护，确保孕妇和胎儿的安全，每年产科收治的孕妇中，约75%为高危孕妇。体外授精胚胎移植及其各项衍生技术在西南地区处于领跑地位，每年完成各项治疗3000余周期，成功率接近40%，四川省首例试管婴儿即是在我院诞生。2000年，小儿血液肿瘤科在西南地区率先开展小儿脐血干细胞移植治疗白血病，小儿白血病完全缓解率达95%以上，5年生存率达70%，达到国内先进水平，造血干细胞移植技术开展顺利。新生儿科是四川省新生儿危急重症救治和转诊中心，每年收治各类早产儿及危重新生儿超过3000例。小儿心血管科是首批在国内开展小儿先天性心脏病介入治疗单位之一，年均完成各类先天性心脏病介入手术500多例，在胎儿期心律失常和心力衰竭诊断和治疗方面居国内领跑地位。我院拥有独立分设的儿童传染性疾病病房，在SARS、甲型H1N1流感、儿童手足口病等流行病的诊疗和防治中做出了突出贡献。
      我院以中国出生缺陷监测中心/全国妇幼卫生监测办公室为核心，确立了以妇幼健康信息采集、加工、整理、利用和实现共享的发展重点，形成覆盖全国31个省（区、市）、334个监测区县、1.4亿人口、监测医院达783所的监测网络，在出生缺陷监测、遗传家系库建设等方面争取到了包括科技部973项目为代表的一大批重大科研项目。设在我院的四川省产前诊断中心除完成本院医疗保健任务外，还承担大量产前诊断与遗传病诊断会诊工作，基本涵盖了目前国内所能进行的产前诊断与遗传病诊断项目。
      2014年全院获准科研项目125项，其中纵向课题40项，获批国家自然科学基金13项，获准科研经费5023.7万元。我院副高以上人员平均科研经费近20万元。2014年全院共发表论文522篇，其中SCI论文118篇；获专利32项。近5年获得的及部省级科技成果有：国家科技进步二等奖1项（第二完成单位），高等学校科学研究优异成果一等奖1项，四川省科技进步奖一等奖2项、二等奖1项、三等奖3项，中华医学科技奖二等奖1项，中华预防医学会科学技术奖二等奖1项。
      长期以来，我院以高度的社会责任感，服务社会、关爱社会，现已与华西医院一道同500多家综合性医院和妇幼保健院签订网络医疗协议。自2003年起开设妇女儿童健康教育公益讲座近700期，医院自筹资金编辑出版《妇幼之家杂志》，免费向病员群众发放。在重大突发公共卫生事件中，全院员工上下一心，为人民健康保驾护航，在公共卫生事件中发挥了重要作用。特别在“5·12”汶川特大地震发生后，医院实施了10余个灾后重建项目。在再生育工程中，设计再生育医疗技术服务方案、流程，加强对基层医务人员的培训，建立了再生育诊治绿色通道。截止2013年年底，累计为1322对再生育夫妇免费就诊，提供优生优育咨询和产前诊断服务近6800人次。