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跨祖先全基因组关联研究--揭示了肺癌的新遗传风险因素
2022-08-03 来源:转化医学网
近日,《Nature Genetics》发表了一篇由贝勒医学院(Baylor College of Medicine)进行的研究“Cross-ancestry genome-wide meta-analysis of 61,047 cases and 947,237 controls identifies new susceptibility loci contributing to lung cancer”,确定了肺癌的新遗传风险因素。
研究背景
“肺癌风险影响所有人群。欧洲血统人群中的风险因素已被广泛研究,但科学家在识别影响非洲和亚洲血统人群的遗传风险因素方面进展较慢。”临床和转化医学研究所所长,医学教授兼流行病学和人口科学临时科长Chris Amos博士说,“通过研究不同的人群,我们才可以更好地了解人群之间不同的风险因素,以及人群之间共享的风险因素如何以不同的方式影响不同的人。”
数据对照与遗传变异影响
为了在不同的人群中鉴定新的肺癌易感位点,团队分析了来自61,000多名肺癌患者和近100万研究对照组的数据。通过跨祖先全基因组关联研究,发现了五个以前未报道的位点。然后,研究人员复制了26个信号,从先前报道的位点中再次确定了10个新的先导关联。
与此同时,研究发现,罕见变异关联往往出现于特定人群。甚至一些已知的风险因素,如影响吸烟行为的CHRNA5和CYP2A6基因,也被发现显示出群体特异性。数据显示,易感性候选基因通常是涉及免疫应答和细胞应激反应的生物学途径的一部分。该研究中发现的一个值得注意的易感基因候选者是IRF4,已知它会导致黑色素瘤,并在这里首次确定其与肺癌风险有关。
研究意义
研究人员还对肺成纤维细胞中的易感基因进行了功能测定,发现包括IRF4在内的许多这些基因在上调时会促进DNA损伤。这种机制可能对未来的肺癌治疗研究很重要。“促进DNA损伤的基因可能是PARP抑制剂治疗的良好靶向候选者,它可以防止癌细胞修复某些类型的DNA损伤。”贝勒大学的博士后助理Jun Xia说,“这些基因在研究对免疫疗法的反应中可能也很重要,因为免疫疗法往往在具有高突变负担的肿瘤中效果较好。
“在未来,我们的研究结果可能有助于识别患肺癌风险较高的人。”贝勒大学流行病学和人口科学医学助理教授Jinyoung Byun博士说,“我们希望更好地了解遗传信息如何帮助人们改变他们的行为,以降低患肺癌的风险。”
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