纽约长老会医院的呼吸科在《美国新闻和世界报道》评定的“2016-17美国医院-呼吸科”排名第八。 纽约长老会医院在过敏、免疫疾病和呼吸系统疾病方面进行广泛的诊断和治疗，中心的肺病过敏和重症医学科被认为是国内优异的肺病治疗科，该科包含几个专业组。 约翰 伍德-约翰 爱德森哮喘中心包含一个专业住院服务和一个专业门诊诊所。中心提供专业诊断服务、免疫疗法和哮喘相关的其他疾病筛查。此外，哮喘中心的员工审查环境诱因以确定哪些室外和室内过敏原可能激活症状。 与心肺相关的睡眠和通气障碍实验室是一个新开发的综合项目，研究各种与睡眠相关的呼吸障碍，如阻塞性睡眠呼吸暂停、呼吸暂停和充血性心力衰竭和神经系统疾病相关的节律性呼吸，婴儿猝死综合症，夜间哮喘，慢性阻塞性肺疾病，神经肌肉疾病等。