大连医科大学附属第二医院始建于1958年，1969年随大连医学院南迁遵义。1987年回迁复建，1991年独立办院。是一所集医疗、教学、科研于一体的大型综合性三级甲等医院。医院由星海院区、钻石湾院区、蓝湾院区、在建旅顺医疗中心组成。年门急诊量150万人次，年出院人数8.5万余人次，年手术例数6万余例。编制床位3000张，人员定编4514人。
医院拥有一支高素质的医疗、护理、教学和科研队伍，一批德高望重的老专家和拥有博士学位以及国外留学经历的中青年学科带头人，构成了医院的人才主体。高级以上职称者近500人，医生中硕士以上学位人员占总数的70%。享受各级政府津贴28人。拥有33 个博士、硕士点，200余名博士、硕士生导师。
医院大力开展学科建设，拥有106个亚专科，七大医疗平台，九大学科群。形成了学科优势和技术特色。以肿瘤疾病综合治疗、终末期肝病一体化治疗、心脑血管病介入治疗、癫痫病综合治疗、糖尿病足特色治疗、新生儿疾病治疗、手足显微治疗等为代表的技术达到国内先进水平。
医院目前拥有国家重点学科2个，分别是：中西医结合临床、中医皮肤病学。国家临床重点专科建设项目1个，为肿瘤科。辽宁省重点学科6个，分别是：内科学（呼吸系统）、外科学（骨外）、内科学（心血管病）、皮肤病与性病学、外科学（普外）、中西医结合。辽宁省诊疗中心4个，分别是辽宁省癫痫疾病治疗中心、辽宁省终末期肝病治疗中心、辽宁省糖尿病足治疗中心、辽宁省医疗会诊中心。大连市重点学科13个，分别为心血管内科、内分泌科、肾脏内科、肿瘤内科、肿瘤放疗科、耳鼻咽喉科、神经内科、眼科、泌尿外科、普通外科、皮肤科、超声科、血液内科。辽宁省医学重点专科建设项目31项。2012年，医院获得大连市快速提升医疗软实力建设项目1个中心、7个基地，分别是：大连肿瘤诊疗中心、大连肿瘤内科诊疗基地、大连肝胆胰肿瘤诊疗基地、大连冠心病诊疗基地、大连糖尿病诊疗基地、大连缺血性脑卒中诊疗基地、大连脑血管病康复基地、大连癫痫病诊疗基地。
医院承担了7个层次、15个专业的临床教学任务，建立了18个教学基地，29个学科成为住院医师规范化培训基地，学院代表大学获得第四届全国高等医学院校大学生临床技能竞赛特等奖。
近五年，医院获得国家、省部级等各级科研课题立项355项，其中国家自然基金重点项目2项，重大项目1项，获得国家、省部级等各级科研获奖56项，获得专利4项；发表论文2904篇，主编、副主编学术专著共46部；有12个专业获得国家食品与药品监督管理局批准的临床药物试验资格。
医院重视学术交流，先后同美国、德国、加拿大、韩国、瑞典、荷兰、日本等国家和地区医院建立友好关系，并与美国西雅图瑞典人医疗中心合作，成立东北头家癫痫病治疗中心。与德国奥尔登堡医院合作，建立中德肿瘤中心。与美国霍普金斯大学医学研究院建立神经医学远程会诊中心。与韩国知名口腔医疗机构建立中韩国际口腔基地。与加拿大不列颠哥伦比亚大学合作成立中加皮肤医学中心。
医院通过资源整合建立起一个以大连医科大学附属第二医院为中心，以信息化为支撑，纵向贯穿三级医院、二级医院、基层医疗机构，横向覆盖疑难重症诊疗、急诊急救、居民健康管理的多维度三级联动医联体模式的辽南地区一位医疗联盟，目前辐射二级医院13家，建成远程心电诊断分站90余家，远程影像诊断分站10家。
医院的数字化建设卓有成效，是卫生部首批数字化医院示范单位。现已形成1000多个工作站的网络系统，实现了HIS、LIS、PACS和PASS系统的一体化建设，首批获得卫生部数字化试点示范医院称号。在大连率先启用支付宝e-门诊，实现手机挂号、缴费、报告查询等，方便患者就医。
医院坚持以人为本、创新发展的办院理念，崇德尚医德院训精神，以建设国内先进、国际知名医科大学相适应的研究型附属医院为目标，社会影响力和患者满意度不断提升。先后获得全国卫生系统先进集体、抗震救灾重建家园工人先锋号、辽宁省精神文明创建活动先进单位、辽宁省卫生系统优质服务二十佳医院、辽宁省抗震救灾先进集体、 辽宁省重点学科建设先进单位、辽宁省住院医师规范化培训先进单位、全国医院文化建设先进单位等荣誉。